Năm 2007, Viện Địa lý vinh dự được chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết trao tặng Huân chương Lao động hạng nhất vì những thành tích xuất sắc trong công tác giai đoạn 2003-2007 góp phần vào sự nghiệp xây dựng Chủ nghĩa xã hội và bảo vệ Tổ quốc.
Trước đó, năm 2003, Viện Địa lý cũng đã vinh dự đón nhận Huân chương Lao động Hạng Nhì do chủ tịch nước Trần Đức Lương trao tặng.
