Địa hình lòng sông: Miền mô hình trước tiên được lựa chọn dựa trên đánh giá mức độ xâm nhập mặn lớn nhất có thể. Miền mô hình sông Trà Lý kéo dài từ thôn Thượng Đạt (xã Đông Dương - huyện Đông Hưng) đến cửa Trà Lý. Các mặt cắt địa hình lòng sông (ký hiệu bằng chữ đỏ trên hình) đã được thu thập xử lý và sử dụng để nội suy thêm các mặt cắt khác (các mặt cắt không ghi ký hiệu trên hình) để xây dựng mô hình địa hình lòng sông.
Các mặt cắt địa hình sông Trà Lý
Các điều kiện ban đầu và biên mô hình: Điều kiện dòng chảy trong sông sử dụng trong mô hình xâm nhập mặn sông Trà Lý được sử dụng trên cơ sở sau. Trong đánh giá khả năng cấp nước và xâm nhập mặn các sông dưới ảnh hưởng xâm nhập mặn thường sử dụng dòng chảy ứng với tần suất 85%. Mực nước và lưu lượng của năm có lưu lượng dòng chảy ứng với tần suất 85% được sử dụng trong mô hình xâm nhập mặn. Mực nước và lưu lượng sử dụng sẽ ứng với lưu lượng tần suất 85% này. Hàm mật độ xác suất Pearson III (phân bố xác suất Gamma ba thông số) dòng chảy được xác định xây dựng cho giá trị ba thông số: vị trí ɛ=6133 m3/s, hệ số tỷ lệ λ=3,16, hình dáng β=1440 với với hệ số biến thiên là 0,24 và hệ số thiên lệch là 1,03. Xâm nhập mặn sông, ngoài ảnh hưởng do lưu lượng dòng chảy trong sông, còn bị quyết định rất lớn của dao động triều. Phục vụ xây dựng kế hoạch khai thác nước từ sông bị ảnh hưởng xâm nhập mặn do triều, mô hình diễn biến mặn được thực hiện trước và kết quả được sử dụng cho công tác xây dựng kế hoạch này.
 |  |
| Đường tần suất lưu lượng nước sông Hồng tại Hà Nội | Mực nước sông Trà Lý P=85% tại thượng lưu MH |
Kết quả diễn biến nồng độ muối:
Vị trí các điểm thể hiện diễn biến mặn theo thời gian tháng 1-4 năm 2012
 |  |
| Nồng độ muối tại Ái Quốc-Đông Trà-Tiền Hải | Nồng độ muối tại Lợi Thành-Đông Quý-Tiền Hải |
 |  |
| Nồng độ muối tại Lương Phú-Tây Lương-Tiền Hải | Nồng độ muối tại Vũ Lăng-Tiền Hải |
